Documentation

Release:0.0.1 Date:November 22, 2021

• Command Line Options
  • swamp-make-library options
  • swamp-mr options
  • swamp-results options

• Clustering subpackage
  • swamp.clustering.clustering module
  • swamp.clustering.optics module
  • swamp.clustering.spectral module
  • swamp.clustering.swampaffinitypropagation module

• Logger subpackage
  • swamp.logger.colorformat module
  • swamp.logger.swamplogger module

• Molecular Replacement subpackage
  • swamp.mr.mr module
  • swamp.mr.mrarray module
  • swamp.mr.mrjob module
  • swamp.mr.mrresults module
  • swamp.mr.mrrun module
  • swamp.mr.searchmodel module
  • swamp.mr.targetdata module

• Parsers subpackage
  • swamp.parsers.aleigenparser module
  • swamp.parsers.gesamtparser module
  • swamp.parsers.mapalignparser module
  • swamp.parsers.mtzparser module
  • swamp.parsers.parser module
  • swamp.parsers.pdbtmxmlparser module
  • swamp.parsers.phaserparser module
  • swamp.parsers.phenixparser module
  • swamp.parsers.refmacparser module
  • swamp.parsers.shelxeparser module
  • swamp.parsers.topconsparser module

• Search subpackage
  • swamp.search.searchjob module
  • swamp.search.searchtarget module

• Utils subpackage
  • swamp.utils.swamplibrary module
  • swamp.utils.targetsplit module
  • swamp.utils.threadresults module

• Wrappers subpackage
  • swamp.wrappers.aleigen module
  • swamp.wrappers.gesamt module
  • swamp.wrappers.mapalign module
  • swamp.wrappers.mtz2various module
  • swamp.wrappers.phenixcc module
  • swamp.wrappers.shelxe module
  • swamp.wrappers.wphaser module
  • swamp.wrappers.wrapper module
  • swamp.wrappers.wrefmac module

• Index
• Module Index